Gazillion Entertaiment ha introducido una nueva característica en Marvel Heroes que nos permitirá reclutar un grupo de héroes para luchar a nuestro lado, los Team-Ups. Están basados en la serie de cómics del mismo nombre que comenzó en 1972, y nos proporcionará la ayuda de nuestros héroes favoritos. En la primera ronda de Team-Ups se incluye a Spider-Man, Falcon, Firestar y Magik.
Con esta característica, el juego ofrecerá más planteamientos en los que basar nuestro estilo de juego, basándonos en los poderes que tenga nuestro Team-Up y teniendo en cuenta sus pros y sus contras.